1/ Rapports d'expertise
2000b, En collaboration avec Lavigne Delville, Ph. & Le Roy, E., Prendre en compte les enjeux fonciers dans une démarche d'aménagement. Stratégies foncières et bas-fonds au Sahel . Coll. Etudes & travaux, Editions du GRET,octobre 2000 : 128p.
2000a, " Publier sur internet, quelques réflexions à propos de " l'écrit d'écran " ", Revue électronique. Usages et Pratiques en Sciences Humaines et Sociales, Journée d'étude du 15 juin 2000, Maison Méditerranéenne des Sciences de l'Homme, http://re.mmsh.univ-aix.fr/bouju.htm#_ednref3
1998c. Approche anthropologique des stratégies d'acteurs et des pouvoirs locaux autour du service de l'eau à Bandiagara, Koro et Mopti (Mali). Opération de recherche n°10. Rapport final, PS/Eau-Ministère de la Coopération: 122p. En ligne à http://home.worldnet.fr/~alainmh/bibliogr.htm. Compte-rendu. 1998. Eau potable et assainissement dans les quartiers périurbains et les petits centres. Coopération Française / Programme Solidarité Eau. Paris: Les éditions du GRET:158 pages.
1998b, " Contrôle foncier & conflits pour les ressources : l'accès aux bas-fonds aménagés comme enjeu de pouvoir local " in Aménagement et mise en valeur des bas-fonds au Mali, Actes du Séminaire de Sikasso, Montpellier: Editions du CIRAD/CBF : 95-108.
1998a, " La sociabilité citadine contemporaine en Afrique de l'Ouest. Entre les défaillances de la solidarité et l'inflation cérémonielle, les amis " se cherchent ". " in Les famille africaines dans la crise : faut-il modifier les politiques publiques ? Expertise collective " Ménages & crise ", ORSTOM : 26-29.
1997 (et al.), " La dynamique des sociétés rurales face aux projets participatifs de développement rural. Réflexions et propositions d'action à partir d'expériences d'Afrique de l'Ouest. ", Coll. Participation populaire n°11, FAO : Rome.
1995b "Enjeux contemporains et structuration de la recherche en anthropologie: L'ethnologie à l'Université de Provence Aix-Marseille 1" , Journal des anthropologues "Les territoires de l'altérité" n°59, hiver 1995: 145-149.
1995a "Anthropologies parallèles: description d'une procédure d'Enquête Anthropologique Rapide (E.A.R.)", Bull. de l'APAD, n° 9, juin 1995: 77-86.
1994 (en collaboration avec C. Falguayrettes-Leveau) Bibliographie générale sur l'art et la culture dogon, (506 titres) in C. Falguayrettes-Leveau (sous la direction de) Dogon, Paris, Editions Dapper: 265-281.
1990b, (En collaboration avec Sidiki Tinta et Claude Pairault) Enquête socio-sanitaire dans le cercle de Bandiagara 1989-1990, Rapport de consultation, Institut National de Recherche en Santé Publique (I.N.R.S.P.) Bamako Division Santé Communautaire, Bamako: 86 p., multigr.
1990a, Analyse ethno-sociologique des trames foncières dans les départements de Kaïn, Koumbri et Sollé. Projet Vivrier Nord Yatenga- Ouahigouya, cartes: 332 p. multigr.(En collaboration avec Konrad Ellsasser): Fichier villages de Banh t.1: 96 p., 5 pl. hors-texte; (En collaboration avec Bruno Martinelli): Fichier villages de Kaïn t.2: 43 p., 5 pl. hors-texte; Fichier villages de Koumbri t.3: 125 p., 5 pl. hors-texte; Fichier villages de Sollé t.4: 41 p., 5 pl. hors-texte.
1989 (En collaboration avec Roger Brand) Analyse socio-anthropologique des trames foncières dans la province de Ganzourgou, A.V.V. Projet U.P.1- Zorgo, 8 tomes (T.1: Généralités; T.2 à T.7: Fichiers de villages pour les 7 départements de la province): 500 p., Cartes, multigr.
1987 " Analyse socio-économique " in Bouju J. et Brand R., Etat des situations socio-économiques et socio-démographiques dans le bassin d'inondation du barrage de la Kompienga (Gourma) Dynamique des grands Projets, Mission Française d'aide et de Coopération technique (financement FAC), Ouagadougou, Burkina Faso: 50 p., multigr.
1982 Les Dogon Karambé. Economie et société, thèse de Doctorat de 3ème Cycle d'Ethnologie et de Sociologie Comparative, Université de Paris X-Nanterre: 279 p., multigr.
2/ Publications scientifiques
2000 " Clientélisme, corruption et gouvernance locale à Mopti (Mali) ", Autrepart, " logiques identitaires, logiques territoriales ", N°14 : 143-163.
1999b " Innovation et découpage territorial. Enjeux politiques autour de la délimitation administrative des communes rurales (Burkina faso) " in L'innovation en agriculture. Questions de méthodes et terrains d'observation, Paris: Editions de l'IRD: 231-241.
1999a " La sociabilité urbaine et la " crise " en Afrique de l'ouest : entre les défaillances de la solidarité familiale et la concurrence cérémonielle, 'on se cherche!' " in Georges Ravis-Giordani (sous la direction de) Amitiés. Anthropologie et Histoire. Université de Provence : 325-355.
1998, " Tutelle clientéliste, despotisme et Patrimonialisme : quelques figures de la chefferie dans les traditions orales dogons " in Jacky Bouju (sous la direction de) "Les Dogons, le pouvoir et la chefferie", Clio en Afrique, 5, automne-hiver 1998 (revue en ligne consultable à l'URL suivante : Erreur! Signet non défini.
1996 "Tradition et identité. La tradition dogon entre traditionnalisme rural et néo-traditionnalisme urbain", Enquête, n°spécial Les usages de la tradition, n°2 : 95-117.
1995c "Fondation et territorialité. Instauration et contrôle rituel des frontières (Dogon Karambé, Mali)", in J.-F. Vincent, D. Dory, R. Verdier (sous la direction de) La construction religieuse du territoire, Coll. Connaissance des hommes, L'Harmattan, Paris : 352-365.
1995 " Qu'est-ce que " l'ethnie " dogon ", in C. Fay (éd), n°spécial : Identités et appartenances dans les sociétés sahéliennes, Cahiers des Sciences Humaines (ORSTOM éditions), Paris, XXXI (2 ) : 329-363.
1994 La statuaire dogon au regard de l'anthropologue, in C. Falguayrettes-Leveau (sous la direction de) Dogon, Paris, Editions Dapper : 221-241, 3 cartes h.t., notes: 256-259.
1991c "Lignage" in Dictionnaire de l'ethnologie et de l'anthropologie sous la direction de Pierre Bonte et Michel Izard Presses Universitaires de France, Paris: 421.
1991b Commentaire de l'article de W. E. A. Van Beek, "DOGON RESTUDIED, A Field Evaluation of the Work of Marcel Griaule", Current Anthropology, Vol.32, N° 2, April 1991: 159-160.
1991a "Pouvoirs et légitimités sur le contrôle de l'espace rural. L'exemple du Ganzourgou (Burkina faso)" in Jean-Pierre Olivier de Sardan et Elizabeth Paquot, (sous la direction de), D'un savoir à l'autre, Ministère de la Coopération et du développement - Groupe de Recherche et d'Echanges Technologiques : 60-70.
1990 "Pratiques économiques et structures sociales: exemples dogon au Mali" in Sociétés, Développement et santé, ouvrage collectif coordonné par Didier Fassin et Yannick Jaffré, Ellipses / Aupelf, Coll. Universités francophones, pp. 155-166.
1984, Graine de l'homme, Enfant du mil, Société d'ethnographie, Coll. Sociétés Africaines, vol. 6: 253 p. (Anthropologie sociale & économique d'un clan dogon du plateau de Bandiagara).