Jusqu'en 1990, les œuvres de Stockhausen ont été enregistrées sur plus de 100 disques. Depuis 1991, Stockhausen-Verlag, la maison d'édition de Stockhausen, réalise une édition complète de toutes les œuvres du compositeur sous son contrôle.

Les éditions Stockhausen-Verlag proposent les œuvres suivantes (les chiffres entre parenthèses correspondent aux références de Disques Compacts disponibles chez Deutsche Grammophon :

CD 1	CHÖRE für DORIS
	CHORAL
	DREI LIEDER
	SONATINE
	KREUZSPIEL
CD 2	FORMEL
	SCHLAGTRIO
	SPIEL
	PUNKTE
CD 3	ETUDE
	STUDIE I and II
	GESANG DER JÜNGLINGE
	KONTAKTE
CD 4	KONTRA-PUNKTE
	ZEITMASZE
	STOP
	ADIEU
CD 5	GRUPPEN
	CARRÉ
CD 6	ZYKLUS
	REFRAIN
	KONTAKTE
CD 7	MOMENTE
CD 8	MIXTUR
CD 9	MIKROPHONIE I
	MIKROPHONIE II
	TELEMUSIK
CD 10	HYMNEN
CD 11	PROZESSION
	CEYLON
CD 12	STIMMUNG
CD 13	KURZWELLEN
CD 14	AUS DEN SIEBEN TAGEN
CD 15	SPIRAL
CD 16	MANTRA
CD 18	STERNKLANG
CD 19	TRANS
CD 20	AM HIMMEL WANDRE ICH
CD 21	YLEM
CD 22	INORI
CD 23	ATMEN GIBT DAS LEBEN
CD 24	TIERKREIS
	MUSIK IM BAUCH
CD 25	HARLEKIN
	DER KLEINE HARLEKIN
CD 27	IN FREUNDSCHAFT (DG 423 109-2)
	TRAUM-FORMEL (DG 423 109-2)
	AMOUR (DG 423 109-2)
CD 28	IN FREUNDSCHAFT (DG 423 109-2)
	AMOUR
	SUSANIs ECHO pour flûte alto
	ZUNGENSPITZENTANZ
	Xi
	FLAUTINA
	YPSILON
	KATHINKAs GESANG
CD 29	DER JAHRESLAUF
CD 30	DONNERSTAG aus LICHT (DG 423 379-2)
CD 31	UNSICHTBARE CHÖRE of THURSDAY aus Licht (DG 419 432-2)
CD 32 Musique pour clarinette, clarinette basse et cor de basset. Avec Suzanne Stephens	LAUB und REGEN
	TIERKREIS
	IN FREUNDSCHAFT
	MONDEVA
	MISSION et ASCENSION
	WOCHENKREIS
	EVAs SPIEGEL
	SUSANI
	YPSILON
	SUKAT
	FREIA
CD 33	ARIES (Markus Stockhausen)
	PIANO PIECE XIII - LUZIFERS Traum (Majella Stockhausen)
CD 34	SAMSTAG aus LICHT (4 CDs) (DG 423 596-2)
CD 35	OBERLIPPENTANZ
	AVE
	TIERKREIS Version pour clarinette, flûte et flûte piccolo, trompette et piano
CD 36	MONTAG aus LICHT (5 CDs)
CD 37	GEBURTSFEST de MONTAG aus Licht
CD 38	GEBURTS-ARIEN de MONTAG aus Licht
	MÄDCHENPROZESSION première version pour chœur de jeunes-filles a cappella et piano
	MADCHENPROZESSION deuxième version pour chœur de jeunes-filles, piano, chœur, orchestre moderne et scènes sonores
CD 40	DIENSTAG aus LICHT (2 CDs)
CD 41	OKTOPHONIE
CD 42	SYNTHI-FOU ( Klavierstück XV) pour synthétiseur et musique électronique
	DIENSTAGS-ABSCHIED pour synthétiseur, chœur et musique électronique - Extraits de SYNTHI-FOU avec Simon Stockhausen (2 CDs)
CD 43 Musique pour trompette, trompette piccolo, flugelhorn. Avec Markus Stockhausen	EINGANG et FORMEL pour trompette (2 CDs)
	EXAMEN
	DRACHENKAMPF
	OBERLIPPENTANZ
	PIETÀ Solo pour flugelhorn et musique électronique
	PIETÀ Duo pour flugelhorn, soprano et musique électronique
CD 44 Musique pour trombone et euphonium	IN FREUNDSCHAFT pour trombone
	SIGNALS et INVASION
	KINNTANZ
CD 45	SOLO pour un instrument mélodique et feedback: version pour flûte (Dietmar Wiesner)
	SOLO version pour synthétiseur (Simon Stockhausen)
	SPIRAL version pour hautbois (Cathy Milliken)
CD 46	SPIRAL version intégrale pour un soliste et récepteur d'ondes courtes (Michael Vetter) (2 CDs)
CD 47	HYMNEN (Troisième région)
CD 48	PAARE aus Mittwoch aus Licht
CD 49	Musique électronique de Freitag aus Licht (2 CDs)
CD 51	WELT-PARLAMENT de Mittwoch aus Licht
CD 52	ORCHESTER-FINALISTEN de Mittwoch aus Licht
CD 53	HELIKOPTER-STREICHQUARTETT de Mittwoch aus Licht (2 CDs
CD 55	BASSETSU-TRIO de Mittwoch aus Licht
	MITTWOCHS-ABSCHIED
CD 56	Klavierstücke I-XIV avec Ellen Corver (3 CDs)
CD 58	LICHTER-WASSER (SONNTAGS-GRUSS)
CD 61	LITANEI 97
	KURZWELLEN (Première mondiale à la radio de Brême, 1968)
CD 62	3x REFRAIN 2000
CD 63	LUZIFERs ZORN
	DIE sieben LIEDER DER TAGE
	DER KINDERFÄNGER